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菌种鉴定--18s

发布日期:2018-01-26 浏览次数:301

真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

传统的真菌分类鉴定主要依据是形态、生长及生理生化变化特征等特征。然而由于真菌种类繁,其生长形态、生理生化变化等随环境的变化也不稳定。因此,采用传统方法鉴定有其局限性。随分子生物技术发展,DNA序列已经广泛测序。通过对真菌保守变异序列测序,可进行菌种鉴定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通过PCR扩增,测序,与GenBank中的已知序列进行比对后,判定真菌种类,将真菌划分到属或种。

提供扩增真菌18S rRNA序列,约1,700 bp,或ITS,大概在300-700bp,进行扩增,测序,BLAST,对样品进行鉴定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2两部分,进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。

服务要求

欢乐时时彩 1.请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。

欢乐时时彩 2. 基因组DNA的浓度≥100 ng/μl,总体积≥20 μl,且无明显降解;平板或斜面应长有分离的单菌落。

欢乐时时彩 3.如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。

服务基本流程

欢乐时时彩 1.进行引物设计合成;

欢乐时时彩 2. PCR扩增18S rDNA/ITS;

3. PCR产物纯化;

4. 测序,序列比对分析。

服务报告内容

欢乐时时彩 实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板




合肥世诚生物技术有限公司

公司地址:合肥高新技术产业开发区望江西路与创新大道交口

联系方式:0551-63463433 / 18755125163

公司技术平台特色:  

分子生物学技术服务项目包括:

TA克隆,亚克隆;质粒构建,荧光定量PCR检测;RNAi干扰;miRNA检测;SNP分型;STR检测等;

蛋白组学技术服务项目包括:

欢乐时时彩 蛋白抽提,蛋白纯化,WB,Elisa,免疫组化,质谱鉴定,N端测序等。

细胞生物学技术服务项目包括:

欢乐时时彩 细胞培养,细胞转染;慢病毒包装;腺病毒包装; 基因编辑;基因敲除;动物造模等;

  • 0551-63463433

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